Sản xuất nông nghiệp của TP.HCM cũng như nhiều địa phương hiện còn manh mụn, chưa có nhiều vùng sản xuất theo tiêu chuẩn, dẫn đến chất lượng hàng hoá không đồng đều, tỉ lệ sản phẩm dán nhãn mác truy suất nguồn gốc không cao.